Peter Pannekoek was sinds 2007 een van de vaste comedians bij de Comedytrain. In 2010 had Peter Pannekoek een eigen voorstelling: De laatste Pannekoek. Hij werd langzaamaan bekender, vooral toen hij wekelijks bij De Wereld Draait Door te zien was. Van 2014 tot 2016 was Peter Pannekoek de weekafsluiter in DWDD. Zijn theaterdebuut was in 2015-2016 met de voorstelling: Zacht van binnen. Ook was Pannekoek in 2016 voor het eerst te zien bij Comedy Central Roast, bij de roast van Gordon. Vanaf 2017 is hij vaste teamcaptain bij het programma: Dit was het nieuws. Ook in 2017 en 2018 heeft Peter Pannekoek meegedaan aan de Comedy Central Roast, waarbij het ging om: Giel Beelen en Johnny de Mol. In de roast van Ali B en Hans Klok is hij niet veel te zien, alleen op een beeldscherm met al opgenomen beeldmateriaal. In 2021 verzorgde Peter Pannekoek de oudejaarsconference bij BNNVARA. Op 24 november 2022 begon Peter met zijn voorstelling: DNA. Het was een groot succes en was maanden van tevoren al helemaal uitverkocht! In 2023 is Peter Pannekoek te zien als presentator bij het programma Waarom gaan we niet vaker? en hij presenteert dat jaar ook voor het eerst het Gouden Televizier-Ring Gala samen met Jan Smit. Ook is Peter Pannekoek weer bij de Comedy Central Roast van Famke Louise te zien.

Peter Pannekoek heeft geen vriendin, ook heeft hij totaal geen kinderwens. Peter Pannekoek zou wel graag een partner willen, hij vertelde laatst dat hij echt wel klaar is voor een nieuwe relatie in zijn leven.

De vader van Peter Pannekoek, Jop Pannekoek, was een televiesieregisseur en zijn moeder, Kathleen Warners is filmrecent voor Saar Magazine. Ook heeft Peter Pannekoek een bekende grootmoeder, Carla Gastkemper. Ze was in de Tweede Wereldoorlog een actieve verzetsstrijder.